Ibu kepada sepasang kanak-kanak perempuan, Victoria Dizon (Megan Charpentier) dan Lily Dizon (Isabelle Nélisse), dibunuh oleh bapa mereka serta-merta membunuh diri dan meninggalkan dua anak perempuannya Ditinggalkan di dalam hutan. Lima tahun kemudian, mereka ditemui dalam keadaan yang sangat miskin, kesepian dan kelaparan. Mereka takut dan tahan terhadap semua sentuhan fizikal. Pakcik Lucas (Nikolaj Coster-Waldau) dan teman wanitanya Annabel (Jessica Chastain) mengambil mereka sebagai anak angkat, dan kehidupan mereka yang asalnya damai telah rosak. Dalam kegelapan, sentiasa ada hantu bayangan, dan hantu ini yang ingin membunuh mereka, dua gadis memanggilnya: Ibu. Filem ini ialah filem cereka pertama pengarah Sepanyol Anders Muschietti dan merupakan pembuatan semula filem pendek 2008 dengan nama yang sama.