Selepas pertempuran raksasa terakhir yang sengit, King Kong dan Godzilla sekali lagi akan bergabung tenaga untuk melawan ancaman besar yang mengintai di dunia, dan secara beransur-ansur meneroka asal-usul binatang gergasi ini dan misteri Pulau Tengkorak dan tempat-tempat lain. Pada masa yang sama, tabir perang purba juga akan didedahkan, dan pertempuran itulah yang mencipta makhluk luar biasa ini dan sangat mempengaruhi nasib dunia manusia.