Kudo Shinichi ialah seorang detektif sekolah menengah yang terkenal di negara Ketika dia menjejaki geng penjenayah lelaki berpakaian hitam, malangnya dia ditemui oleh ahli kumpulan selepas pengsan dan diberi ubat ajaib, Kudo Shinichi kembali menjadi kanak-kanak. Shinichi menjumpai Dr. Ali yang sering membantunya, dan doktor itu menjahit banyak senjata pengintip untuknya. Untuk mengelakkan kumpulan penjenayah daripada bertindak balas terhadapnya, Shinichi memutuskan untuk kekal tanpa nama dan menjejaki mereka secara rahsia, dengan harapan untuk mendapatkan penawarnya. Pada suatu hari, teman wanita Xinyi, Mao Lilan datang ke rumah Dr. Ali untuk mencari keberadaan teman lelakinya, Xinyi, yang telah dilanggar oleh Xiaolan, membuat namanya Edogawa Conan dalam keadaan terdesak, dan kemudian Conan tinggal di rumah Xiaolan. Bapa Xiaolan, Mouri Kogoro, adalah seorang detektif swasta Shinichi boleh bekerjasama dengannya dalam empat kes untuk menjejaki keberadaan Night Man. Conan bertemu Ayumi dan pelajar sekolah rendah lain di sekolah rendah, dan bersama-sama mereka menganjurkan pasukan detektif juvana untuk mengisytiharkan perang terhadap penjenayah!