Ini adalah dunia di mana ninja masih aktif di atas pentas. Walau bagaimanapun, tidak seperti dahulu, ninja hari ini kebanyakannya bekerja untuk lelaki kaya dan ahli politik, membantu mereka melakukan beberapa perkara buruk yang telah hilang kepercayaan dipanggil ninja jahat. Untuk memerangi kuasa toleransi jahat yang semakin meningkat, kerajaan telah menubuhkan Akademi Hanzo sebagai tempat untuk memupuk kebaikan dan toleransi. Homura yang polos dan lincah (disuarakan oleh Eri Kitamura), Ei (disuarakan oleh Meino Ai) yang dilahirkan dalam kemiskinan tetapi mempunyai kemahuan yang luar biasa, Hikage yang pendiam (disuarakan oleh Ryoko Shiraishi), yang kelihatan seperti kanak-kanak tetapi sebenarnya. .. Mirai (disuarakan oleh Saori Goto) yang sangat mengambil berat tentang sosoknya, dan Haruka (disuarakan oleh Toyoguchi Emi) yang berkulit gelap dan licik tetapi sebenarnya penuh dengan kemuliaan keibuan, lima gadis ini bertemu di sekolah.