Pada tahun 2013, bandar NO.6. Ini adalah negara yang ideal di mana tiada jenayah, tiada penyakit, tiada peperangan, tiada apa yang dipanggil kesakitan dan kebencian. Shion genius berusia 12 tahun (disuarakan oleh Kaji Yuki), yang selalu berfikiran demikian, tinggal bersama ibunya di kawasan perumahan mewah di No. 6. Pada malam yang ribut, dia bertemu dengan seseorang yang mengubah pandangan dunianya. - seekor tikus muda yang berparut dan agresif (Disuarakan oleh Yoshimasa Hosaya). Shion yang ingin tahu dan menggemari tetikus itu bukan sahaja tidak berasa takut malah turut menyelamatkan tetikus itu Akibatnya, dia dianggap menyembunyikan suspek, dilucutkan segala keistimewaan, dan kemudian menjadi renjer taman. Selepas mengalami kejadian ini, Ziyuan mempunyai keraguan tentang dunia ideal yang dia tinggali, dan insiden kematian ngeri kerap berlaku di bandar. Peristiwa ini berkait rapat dengan NO.6, yang semakin keliru, tidak tahu bahawa dia berada di ambang hidup dan mati Pada saat genting, dia diselamatkan oleh seekor tikus yang tidak kelihatan selama empat tahun dan datang kepada golongan miskin di luar daerah NO.6. Di sini, Ziyuan secara beransur-ansur menyedari kebenaran tentang No. 6, dan bahayanya jauh dari meninggalkan mereka...